Lista de exercícios 3

  1. Escreva um programa que defina o melhor template para uma sequência (Dicas: use BLAST; baixe os dados de sequência e estrutura no PDB).
  2. Escreva um programa que faça o alinhamento entre duas sequêncais (Dica: use o clustal).
  3. Faça a um programa que construa 100 modelos para uma proteína (Dica: use o MODELLER).
  4. Faça um programa que calcule qual o melhor modelo (Dica: leia a função DOPE).
  5. Automatize todos os programas criados até o momento em um único pipeline.